전장유전체 변이분석의 이해 수료증
모집인원999명
학습기간2024-03-01 ~ 2024-12-31
강의 소개 및 개요입니다.
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성명 |
안준용 |
소속기관 |
고려대학교 바이오시스템의과학부 |
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과목명 |
전장유전체 변이 분석의 이해 |
강의시간 |
4시간 |
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학습목표 |
본 강의는 전장유전체 (whole genome sequencing) 분석에 필요한 기본개념을 학습한다. 전장유전체 데이터 분석 및 활용을 위한 분석 플랫폼 Hail 기본개념을 학습하고 실무 모듈을 연습한다. Hail 실습을 통해, 향후 전장유전체 기반 신약개발 및 인공지능 기반 유전체 연구에 필수적인 분석 기본을 학습하고자 한다. |
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강의 선수과목 및 준비사항입니다.
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선수과목 |
차세대 염기서열 분석 – 남진우 교수 Genomics analysis – 김상우 교수 |
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참고자료 |
- https://hail.is/ Hail 웹사이트 |
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준비사항 |
- 구글 코랩이 연결되는 인터넷 |
전장유전체 변이분석의 이해 강의 과정입니다.
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1 |
강의 제목: 전장유전체 유전연관성 방법론 소개 및 유전적 조성 소개 전장유전체를 활용한 연구 개발에 필수적인 분석 방법론을 학습하고, 데이터 해석에 필수적인 유전적 조성에 대한 기본 개념을 학습한다 |
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2 |
강의 제목: Hail 기본 개념 소개 전장유전체 분석 Hail 플랫폼의 기본개념과 함께 전장유전체 데이터 양식을 학습한다. 전장유전체를 통한 유전변이 발굴 방식과 발굴과정에 연관된 품질지표, VCF 데이터 양식의 기본에 대하여 학습한다. |
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3 |
강의 제목: Hail 기반 전장유전체 실습 I Hail 플랫폼을 활용하여 전장유전체 데이터 분석을 실습한다. 본 실습에서는 Hail 유전체 데이터프레임의 기본 구조, 샘플 메타정보 활용 및 품질 지표 탐색에 대한 기본 개념을 학습한다. |
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4 |
강의 제목: Hail 기반 전장유전체 실습 II Hail 플랫폼을 활용하여 전장유전체 데이터 분석을 실습한다. 본 실습에서는 전장유전체 데이터 분석에 필수적인 샘플 및 변이 수준의 정도관리, 유전연관성 산출 방식 방법론 및 Qualifying variant 전처리 추출 방식 등을 학습한다. |