전사체 데이터 분석 수료증

  • 모집인원999명

  • 학습기간2024-03-01 ~ 2024-12-31

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강좌 소개

 

강의 소개 및 개요입니다. 

성명

남진우

소속기관

한양대학교

과목명

전사체 데이터 분석 (Transcriptome analysis)

강의시간

7

학습목표

1. 전사체 데이터의 기본적 특성과 연구목적에 대해 이해한다.
2. 전사체 데이터의 종류와 연구목적에 따른 활용 방법을 이해한다.
3. Short, long-read를 각각 활용한 전사체 분석 방법에 대해 이해한다.
4. Bulk 수준의 전사체 데이터와 단일세포 전사체 분석의 차이와 활용에 대해 이해한다

 

강의 선수과목 및 준비사항입니다.

선수과목

유전자 발현 분석, 차세대서열데이터 분석(Intronduction to NGS data analysis)

참고자료

 -

준비사항

노트북 웹브라우저 

과정 소개

전사체 데이터 분석 강의 과정입니다.

1

[전사체의 다양성과 정성, 정략적 개념]

전사체가 무엇인지 이해하고, Central dogma에 따른 전사체의 다양성과 복잡도에 대해 이해하며, 그 특성과 정성, 정량적 연구를 이해한다.

-전사체란 무엇인가?
-전사체의 종류와 다양성
-전사체의 정성, 정량적 연구

2

[RNA-seq 데이터 특성과 분석 1]

RNA-seq 데이터 특성에 대해 이해하고 이에 따른 적절한 활용방법에 대해 이해한다.

-RNA-seq 라이브러리 구축 방법과 데이터 특성

-RNA-seq 데이터 특성에 따른 QC와 기본 분석

-RNA-seq을 이용한 데이터 분석 활용 연구 예시

3

[RNA-seq 데이터 특성과 분석 2]

2, 3세대 Short/Long RNA-seq 데이터의 차이에 대해 이해하고, 그 활용 방법에 대해 이해한다.

-3세대 long read RNA-seq 데이터의 차이와 활용 구분

-Long read RNA-seq 데이터 활용의 장, 단점

-Long read RNA-seq 데이터 활용 연구 예시

4

[비암호화 전사체 데이 터의 종류와 활용 1]

miRNA의 생성, 분해, 유전자 조절 기전에 대해 이해하고, NGS를 이용한 연구 방법에 대해 이해한다.

-ncRNA와 miRNA란 무엇인가?
-miRNA 생성 기전과 분해

-miRNA targeting을 통한 유전자 발현 조절

5

[비암호화 전사체 데이터의 종류와 활용 2]

sRNA-seq 데이터를 이용한 다양한 miRNA 분석 방법에 대해 이해한다.

- sRNA-seq 데이터를 이용한 miRNA 생성, 분해기전 분석
- sRNA-seq 데이터를 이용한 noncanonical miRNA 분석

6

[비암호화 전사체 데이터의 종류와 활용 3]

total RNA-seq을 이용한 long ncRNA 연구방법에 대해 이해한다.

- lncRNA 개념과 생성, 진화, 조절 기능
- Transcriptome assembly와 lncRNA 동정 및 분석

7

[단일세포 전사체 개념과 활용]

bulk 수준의 전사체와 구별되는 단일세포 전사체의 특성과 이를 활용하는 방법에 대해 이해한다.

- 단일세포 전사체 데이터의 특성과 Bulk RNA-seq 비교
- 단일세포 전사체 데이터 기본분석과 활용

분류
  • 주제
    전사체학
  • 분야
    생물학 & 생물정보학
  • 실습
    없음 (이론 강의)
  • 활용 단계
    Target Identification
교수자/개설자