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생명정보개론
숭실대학교 김상수 교수님 유튜브 채널에서 제공하는 강의입니다.
강의 목표
병원을 통하지 않고, 일반인도 유전자 검사를 받을 수 있는 시대가 되어서, 특정 질환에 걸릴 위험도를 높이는 유전자 변이를 가지고 있는지 알 수 있게 되었다. 본 강좌에서는 비전문가인 일반인이 유전자 검사 결과를 해석하는데 필수적인 바이오 데이터베이스 검색 및 바이오 데이터 분석 소프트웨어의 활용에 관한 이론을 공부하고, 컴퓨터 실습을 통하여 익혀서, 생명정보학에 대한 기본 개념을 습득하는 것을 목표로 한다.
강좌운영계획
| 1 | 왜 생명정보 기술이 필요한가? |
| 2 | 문헌데이터베이스 살펴보기 |
| 3 | 차세대 염기서열 해독법 알아보기 |
| 4 | 변이데이터베이스 알아보기 |
| 5 | 염기서열 데이터베이스 알아보기 |
| 6 | 염기서열을 단백질 아미노산 서열로 번역하기 |
| 7 | 게놈서열 데이터베이스 활용법 |
| 8 | 염기 및 단백질 서열 정렬 원리 및 소프트웨어 실습 |
| 9 | 단백질 서열에서 발견되는 도메인 구조 확인하기 |
| 10 | 단백질 서열 데이터베이스 알아보기 |
| 11 | 단백질 합성 후 화학적 수식화의 종류 및 예측법 |
| 12 | Gene Ontology의 개념 및 단백질의 세포 내 위치 |
| 13 | 단백질 3차원 구조 데이터베이스 검색 및 구조 가시화 |
| 14 | 단백질과 화합물이 복합체를 이루는 것을 3차원 구조적으로 확인 |
강좌수준
현대 생명과학 연구를 통하여 엄청난 규모의 바이오 빅데이터가 축적되고 있으며, 이 지식의 보고를 잘 활용하는 것은 생명과학의 발전에 매우 중요합니다. 따라서 바이오 데이터베이스 및 분석 도구의 활용은 생명과학을 공부하고자 하는 모든 사람들에게 필수적인 기술입니다. 생명정보기술은 일반인도 쉽게 접근하여 활용할 수 있도록 개방되어 있기에, 이 분야에 대한 흥미를 갖고 있거나, 전공을 고려하는 사람들에게도 추천합니다. 학술 문헌에 보고된 개인 유전자 검사의 실사례를 중심으로 강의를 전개하기 때문에, 그 결과를 해석하기 위한 기초 소양을 쌓는데도 도움이 됩니다.
이 강좌를 듣기 위해 미리 수강해야 하는 과목은 따로 없습니다. 그렇지만, 고등학교 수준의 생물학 지식은 필요합니다. 대부분의 교육 자료를 영문으로 된 해외 인터넷 사이트를 이용하기에 고등학교 수준의 영어 실력을 요구합니다.
Lectures(42)
생명정보개론 제0강 파트1 - 강좌소개 및 수강 방법
36:00
생명정보개론 제0강 파트2 - 동영상 시청, 유투브, 퀴즈 사용법
07:00
생명정보개론 제1강 파트1 - 왜 생명정보인가? Nic Volker 스토리
29:00
생명정보개론 제1강 파트2 - 개인유전체 시대의 도래, 합성생물학, BIT 융합
27:00
생명정보개론 제2강 파트1 - 문헌데이터베이스
22:00
생명정보개론 제2강 파트2 - 학술논문의 구조
29:00
생명정보개론 제2강 파트3 - 학술논문의 초록에 대해서
24:00
생명정보개론 제2강 파트4 - 문헌데이터베이스 PubMed
04:00
생명정보개론 제2강 파트5 - 문헌데이터베이스 Google Scholar
09:00
생명정보개론 제3강 파트1 - Exome 시퀀싱의 필요성
26:00
생명정보개론 제3강 파트2 - Exome이란? Sanger 시퀀싱의 원리
10:00
생명정보개론 제3강 파트3 - Exome 시퀀싱의 원리
30:00
생명정보개론 제4강 파트1 - Variant annotation overview
02:00
생명정보개론 제4강 파트2 - SNP란? dbSNP 소개
40:00
생명정보개론 제4강 파트3 - dbSNP 데이터베이스 검색 실습
14:00
생명정보개론 제5강 파트1 - Nucleotide RefSeq & translation
40:00
생명정보개론 제5강 파트2 - Transcript variants: alternative splicing
17:00
생명정보개론 제5강 파트3 - Gene database
23:00
생명정보개론 제5강 파트4 - Exome variant annotation
31:00
생명정보개론 제6강 파트1 - 단백질번역 애니메이션
19:00
생명정보개론 제6강 파트2 - 단백질번역 ORF Finder
26:00
생명정보개론 제6강 파트3 - 아미노산 구조 게임
20:00
생명정보개론 제7강 파트1 - GenomeBrowser NCBI
29:00
생명정보개론 제7강 파트2 - GenomeBrowser UCSC
37:00
생명정보개론 제8강 파트1 - SNP to PubMed
25:00
생명정보개론 제8강 파트2 - SNP in UCSC Genome Browser
41:00
생명정보개론 제9강 파트1 - BlastP to Gene Tree
36:00
생명정보개론 제9강 파트2 - bl2seq & blast 원리
55:00
생명정보개론 제10강 파트1 - NCBI CDD 데이터베이스 및 PSSM
25:00
생명정보개론 제10강 파트2 - RPS-Blast, Pfam 검색
30:00
생명정보개론 제11강 - 파트1 UniProt DB
39:00
생명정보개론 제11강 - 파트2 UniProt AS via UCSC Genome Browser
13:00
생명정보개론 제12강 파트1 - PTM 소개 (phosphorylation, glycosylation 등)
38:00
생명정보개론 제12강 파트2 - PTM 예측 실습
31:00
생명정보개론 제13강 파트1 - Gene Ontology & Subcelluar localization
40:00
생명정보개론 제13강 파트2 - 단백질 topology 예측
17:00
생명정보개론 제14강 파트1 - UniProt to PDB
20:00
생명정보개론 제14강 파트2 - 3Dviewer: Basics
42:00
생명정보개론 제14강 파트3 - 3Dviewer: Measurements
45:00
생명정보개론 제14강 파트4 - Secondary Structures
14:00
생명정보개론 제15강 파트1: 단백질 저해제 모델, 거리 측정
31:00
생명정보개론 제15강 파트2: 비가역적 저해제, induced fit
45:00
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