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NGS 데이터 분석
숭실대학교 김상수 교수님 유튜브 채널이 제공하는 NGS 데이터 분석 강의입니다.
강의 내용
- NGS 기술의 발달 및 활용 범위
- 차세대 염기서열 분석법 원리
- NGS 데이터 구조와 형식
- NGS 데이터 정도 관리
- NGS 데이터 게놈 매핑
- SAM/BAM 파일 생성 및 관리
- 매핑 가시화 및 변이 정보 찾기
- 게놈 매핑되지 않은 reads 조립하기
- Exome-seq 변이 발굴
- VCF 파일의 변이 주석 달기
- 암 체세포 변이 분석 원리 및 주석 달기
- RNA-seq의 원리 및 발현 분석
- ChIP-seq 의 원리와 종류
Lectures(53)
ngsEconomy1
10:00
ngsEconomy2
11:00
ngsApplication1
30:00
ngsApplication2
19:00
ngsApplication3
09:00
ngs Illumina
19:00
ngs iontorrent
13:00
ngs PacBio
14:00
ngs Nanopore
12:00
ngs fastq download
14:00
ngs fastq format
21:00
ngs fastq quality
11:00
ngs fastq viewing
07:00
ngs fastqc
31:00
ngs trimming
30:00
ngs mapping
25:00
ngs mappingAlgorithm
28:00
ngs sam cigr
08:00
ngs sam flags
10:00
ngs sam overview
19:00
ngs sam samtools
23:00
ngs tablet
26:00
ngs variantCalling1
19:00
ngs variantCalling2
24:00
ngs unmappedIntroduction
08:00
ngs unmappedReadsCollection
08:00
ngs unmappedSOAPdenovoBlastX
09:00
ngs unmappedSOAPdenovoConfig
07:00
ngs unmappedSOAPdenovoInstall
06:00
ngs unmappedSOAPdenovoRun
13:00
ngs exomeSeq1introduction
08:00
ngs exomeSeq2capture
07:00
ngs exomeSeq3BamBcfTablet
20:00
ngs exomeSeq4Tablet
07:00
ngs exomeAnno1Introduction
13:00
ngs exomeAnno2VEP
16:00
ngs exomeAnno3TiTv
07:00
ngs exomeAnno4CSQ
09:00
NGS cancer1Introduction
07:00
NGS cancer2SomaticCalling
06:00
NGS cancer3MuTectCalling
17:00
NGS cancer4CRAVAT
14:00
NGS RNAseq1Intro
07:00
NGS RNAseq2JunctionMapping
04:00
NGS RNAseq3TabletViewing
18:00
NGS RNAseq4ExpressionLevel
16:00
NGS RNAseq5Isoforms
06:00
NGS RNAseq6FusionGene
05:00
NGS ChIPseq1whyChIPseq
16:00
NGS ChIPseq2ChIP
06:00
NGS ChIPseq3ChIPseqPrinciple
08:00
NGS ChIPseq4HistoneMod
06:00
NGS ChIPseq5ChIPseqExample
21:00
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