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09-01-2024 ~ 12-31-2029

Course Introduction

성명 선 호 근 소속기관 부산대학교 통계학과 강의 명 (주제) R을 활용한 유전체 빅데이터 통계 분석 (Statistical analysis of high-dimensional genomic data using R) 학습목표 유전체 발현량 데이터와 DNA 메틸화 데이터와 같은 고차원 유전체 데이터를 분석하는 통계적 검정 방법들과 벌점함수 기반 변수선택 방법들을 학습시키고,  통계 패키지 R을 사용하여 실제 유전체 빅데이터를 분석하는 실습을 통해 학생들의 데이터 분석 능력을 향상시킨다. 분야 AI, Bio 단계 기초 및 심화

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03-01-2024 ~ 12-31-2024

Course Introduction

강의 소개 및 개요입니다.  성명 신현길 소속기관 안전성평가연구소 과목명 독성 예측 인공지능 모델 활용 강의시간 6시간 학습목표 1. 무료로 사용 가능한 독성 예측 프로그램 설치 및 활용 방법 익히기 2. python을 이용한 데이터 분석 및 처리 방법 익히기 3. 예측 모델 개발을 위한 python 코드 완성해보기   강의 선수과목 및 준비사항입니다. 선수과목 파이썬 프로그래밍 기초(2-5강), 화학정보학개론, QSAR, RDKit의 기초와 이를 이용한 화학정보학 실습 참고자료 RDKit의 기초와 이를 이용한 화학정보학 실습 [강사 강원대학교 이주용] 1. 컴퓨터를 이용한 신약 개발 방법론 https://www.ibric.org/myboard/list.php?Board=news&Page-2&&PARA3-21) 2. pubchempy (https://pubchempy.readthedocs.io/en/latest/) 3. openbabel 파이썬 모듈 http://openbabel.org/wiki/python) 참고자료 4. MOPAC 홈페이지 (http://openmopac.net/) 5. Chembl 데이터베이스 (https://www.ebi.ac.uk/chembin 6. binding DB (https://www.bindingdb.org/rwd/bind/index.jsp) 7. DILIrank 미국 FDA에서 정리한 데이터 베이스 (classificaion 모델 개발용 데이터) https://www.fda.gov/science-research/liver-toxicity-knowledge-base-ltkb/drug-induced-liver-in jury-rank-cdilirank-dataset) 준비사항 아나콘다 파이썬으로 진행(아나콘다 파이썬이 아닌 경우 pandas, matplotilb, sci-kit learn 모듈 추가 설치 필요) 아나콘다 파이썬에서 추가 설치가 필요한 모듈 (pubchempy, mopac, openbabel, joblib) 아나콘다에서 제공하는 spyder 사용방법 숙지(다른 IDE 호라용해도 문제 X) text editor 프로그램(Atom, Sublime 등) binding DB 데이터 활용을 위한 홈페이지 가입 필요

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03-01-2024 ~ 12-31-2024

Course Introduction

강의 소개 및 개요입니다. 성명 김상욱 소속기관 포항공과대학교 생명과학과 과목명 빅데이터를 활용한 비임상시험 동물모델 개발 강의시간 2시간 학습목표 비임상시험에서 사용되는 세포와 동물모델과 임상시험에서 사람에 대한 약물의 반응 차이를 알아내기 위해 다양한 빅데이트를 이해하는 방법론을 이해   강의 선수과목 및 준비사항입니다. 선수과목 일반생명, 생화학 참고자료 Divergence of noncoding regulatory elements explains gene-phenotype differences between human and mouse orthologous genes Molecular Biology and Evolution. 2018 Jul 1;35(7): 1653-1667. doi: 10.1093/molbev/msy056   Evolutionary rewiring of regulatory networks contributes to phenotypic differences between human and mouse orthologous genes. Nucleic Acids Res. 2022 Feb 28;50(4):1849-1863. doi: 10.1093/nar/gkac050. 준비사항  -

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03-01-2024 ~ 12-31-2024

Course Introduction

강의 소개 및 개요입니다. 성명 남진우 소속기관 한양대학교 과목명 서열분석(DNA,RNA,Protein) 강의시간 4 학습목표 1. DNA, RNA, Protein 서열의 기본적인 정보처리, K-mer 분석, 통계분석에 대해 이해한다.2. DNA, RNA, Protein의 서열의 유사도를 측정하는 기본적일 알고리즘을 이해한다.   강의 선수과목 및 준비사항입니다. 선수과목  일반생물학 참고자료  - 준비사항  노트북 웹브라우저

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03-01-2024 ~ 12-31-2024

Course Introduction

성명 김화종 소속기관  강원대학교 과목명  신약개발에 필요한 머신러닝 이해 강의시간  9 모듈 학습목표 신약개발에 필요한 화합물 데이터를 다루는 방법을 배우고 화합물의 속성을 수치 테이블로 표현하는 방법, Fingerprint, 그래프 등으로 표현하는 분자 표현형을 설명한다. 머신러닝 모델을 구현하는 방법과 랜덤포레스트, MLP, CNN, Graph CNN 등을 배우고 VAE와 GAN 등 생성 모델을 이용한 분자 생성 방법을 배운다.

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03-01-2024 ~ 12-31-2024

Course Introduction

강의시간 강의내용 실습여부 1 유전변이 데이터 기본 유전변이의 개념과 종류 유전변이 데이터의 수집과 저장 방법 N 2 유전변이 annotation과 약물 유전자 데이터베이스 유전변이 annotation 방법 소개 약물 유전자 데이터베이스의 활용 방법 N 3 암유전체를 이용한 약물유전체 분석 실습 1 암과 관련된 유전체 데이터의 수집과 분석 방법 약물유전체 분석에 활용되는 도구와 기술 Y 4 암유전체를 이용한 약물유전체 분석 실습 2 암유전체 분석을 통한 약물 효능 예측 방법 유전체 변이 데이터를 활용한 개인 맞춤형 약물 치료 방법 Y 5 CNV 유전변이 분석 실습 Copy Number Variation (CNV) 유전변이의 개념과 분석 방법 CNV 데이터를 활용한 약물 유전체 연구 사례 Y 6 Noncoding 유전변이 분석 실습 비코딩 영역의 유전변이 분석 방법과 중요성 Noncoding 유전변이와 약물 반응의 관련성 연구 사례 Y 7 희귀질환 약물유전체 분석 실습 희귀질환과 관련된 유전변이 분석 방법 희귀질환 치료를 위한 약물유전체 연구 사례 Y 8 약물반응성 유전 연관성 대규모 데이터 분석 실습 대규모 유전체 분석을 위한 분석 플랫폼 실습 대규모 유전체 데이터 형태 학습 Y

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03-01-2024 ~ 12-31-2024

Course Introduction

강의 소개 및 개요입니다.  성명 조한석 소속기관 AITRICS 과목명 효율적인 딥러닝 코드 작성을 위한 파이토치 라이트닝 기초 강의시간 3시간 학습목표 딥러닝 모델 학습 코드를 작성하다보면 비슷한 구조가 반복되는 것을 알 수 있다. 파이토치 라이토닝(pytorchlightning)은 딥러닝 학습을 구조화한 프레임워크로 유연(flexble)하고 재현 가능한(reproducible) 코드를 만드는데 유용하며, 특히 적은 노력으로 딥러닝 학습 코드를 작성하는데 큰 도움을 준다. 이 강의에서는 파이토치 라이트닝과 WandB를 이용하여 효율적으로 딥러닝 코드를 작성하고 실험 관리하는 방법을 익힌다.   강의 선수과목 및 준비사항입니다. 선수과목 파이썬 프로그래밍기초, 기계학습, 파이토치 기초 참고자료 https://pytorch-lightning.readthedocs.io/en/latest/ 준비사항 녹화 가능한 강의 툴

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