교수자/개설자

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학습기간

2024-10-11 ~ 2029-12-31

강좌소개

성명 박대찬 소속기관 아주대학교 강의 명 (주제) NGS와 AI를 이용한 항체 레퍼토리 (repertoire) 분석 학습목표 생체 내에서 B 세포의 발달 및 B cell receptor (BCR 또는 항체)의 다양성과 항원 특이성이 확보되는 면역학 기초를 배운다. 천문학적인 BCR 다양성 분석을 위해 NGS 기반 BCR 시퀀 싱 데이터를 생산하는 최신 연구 기법을 학습한다. 생명정보학적 분석법으로 BCR의 V gene usage와 complementarity-determining regions (CDR) 서열을 동정하는 법을 배우고 딥러닝으 로 대규모 DNA 서열과 아미노산 서열을 학습하는 방법을 배운다. 분야 Bio   단계 기초

참여자수

29

교수자/개설자

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학습기간

2024-03-01 ~ 2024-12-31

강좌소개

강의 소개 및 개요입니다. 성명 김우연 소속기관 KAIST 과목명 AI in Predicting Protein-Ligand Interaction (structure-based) 강의시간 8 학습목표 1.단백질 구조 기반 Protein-Ligand Interaction 에 대한 다양한 AI 예측 모델들을 살펴본다. 2. 예측의 정확도 및 일반화 측면에서 다양한 방법들의 장단점을 이해한다.   강의 선수과목 및 준비사항입니다. 선수과목 al Screening (이주용), Deep learning approach (김동섭), Deep learning frameworks (김학수), Deep learning Basic (김학수  참고자료  981 (2019)), GNN-Torg (JCIM, 59, 4131 (2019)), GNN-Jiang(RSCAdv 20, 20701 (2020)), DeepFusion (JCIM, 61, 1583 (2021)), PoseR 준비사항  x

참여자수

134

교수자/개설자

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학습기간

2024-03-01 ~ 2024-12-31

강좌소개

강의 소개 및 개요입니다. 성명 이세한 소속기관 Hits 과목명 Molecular Representation Learning & Property Prediction 강의시간 5 학습목표 1. 분자 표현을 이해하고 인공지능 학습에 활용 할 수 있다.2. SMILES, fingerprint, pharmacophore, embedding 등의 분자 구조 표현 방법을 학습한다.   강의 선수과목 및 준비사항입니다. 선수과목  - 참고자료  - 준비사항 노트북 사용, discovery studio visualizer & PaDEL 설치 

참여자수

43

교수자/개설자

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학습기간

2024-03-01 ~ 2024-12-31

강좌소개

강의 소개 및 개요입니다.  성명 홍승환 소속기관 한국제약바이오협회 과목명 protein data bank 분석 강의시간 3 학습목표 (1) Protein Data Bank로부터 pdb 단백질 3D 구조 파일을 얻고, pdb 파일을 파싱하는 방법에 대해 설명한다. (2) pdb 구조로부터 단백질-리간드 상호작용을 분석한다. (3) 단백질 데이터베이스 Uniprot에서 제공하는 정보에 대해 설명하고, 신약개발에 활용하는 방법을 알아본다.   강의 선수과목 및 준비사항입니다. 선수과목 단백질 구조 결정학, 단백질 구조기반 신약설계 참고자료 도서, 웹사이트, 논문 등 준비사항 linux (windows WSL), Python, Anaconda  

참여자수

107

교수자/개설자

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학습기간

2024-03-01 ~ 2024-12-31

강좌소개

강좌 소개 및 개요입니다. 성명 홍승환 소속기관 한국제약바이오협회 과목명 도킹 프로그램 사용 실습 강의시간 4 학습목표 도킹에 필요한 단백질 구조를 선택하고, 단백질과 분자 전처리 방법을 설명 도킹 프로그램 (AutoDock Vina 및 변종, rdock 사용 실습 도킹 결과 구조를 분석하는 방법에 대해 설명한다.)   강의 선수과목 및 준비사항입니다. 선수과목 protein data bank 분석, SMARTS를 이용한 분자 서브 구조 검색 참고자료 도서, 웹사이트, 논문 등 준비사항 강의에 필요한 환경 등

참여자수

149

교수자/개설자

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학습기간

2024-03-01 ~ 2024-12-31

강좌소개

강의시간 강의내용 실습여부 1 분자역학 - 신약개발 프로세스, 이성질체, 이면각   2 분자동력학 시뮬레이션 - Time, Size scales, 분자역학 에너지 함수, 카이랄성, 역 장, 프로그램, 응용예제   3 단백질 모델링 알고리즘 - 극소/최소 최적화   4 단백질 구조 기반 피쳐 분석 - PDB 핸들링, Rg, Distance matrix (실습) O 5 분자역학 프로그램 CHARMM : 인스톨, CHARMM-gui (실습) O 6 Conformational analysis (실습) O 7 Protein - ligand MD simulation (실습) O

참여자수

62