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Learning Period

03-01-2024 ~ 12-31-2024

Course Introduction

강의 소개 및 개요입니다. 성명 남호정 소속기관 GIST 과목명 Lecture : AI in Predicting Drug-protein Interaction(sequence-based) 강의시간 2 학습목표 1. 단백질 서열을 사용하여 화합물-단백질 상호작용을 예측하는 다양한 방법론을 학습한다.2. 기계학습, 딥러닝 기반 화합물-단백질 상호작용 예측 모델들에 대해 학습한다.   강의 선수과목 및 준비사항입니다. 선수과목 Deep Learning Advanced (inductive bias, self-supervised learning, semi-supervised learning, Attention, Transformeretc.)Graph Deep Learning(GCN, GAT, GIN, GGNN, MPNN, etc.) 참고자료 doi: 10.1093/bib/bbz157doi: 10.1093/bib/bbab046 준비사항  Colab 접속 가능 환경

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03-01-2024 ~ 12-31-2024

Course Introduction

강의 소개 및 개요입니다. 성명 이주용 소속기관 서울대학교 과목명 RDKit의 기초와 이를 이용한 화학정보학 실습 강의시간 10 학습목표 1. RDKit의 기본 기능을 익혀 기본적인 분자 입출력 및 물성 분석을 할 수 있다2. Cheminformatics의 기본 개념을 이해하고 실제로 최신 연구에서 어떻게 사용되고 있는지 살펴본다   강의 선수과목 및 준비사항입니다. 선수과목  파이썬, 주피터 노트북, anaconda 또는 venv 같은 가상환경 생성 프로그램 참고자료  www.rdkit.org, 핸즈온 머신러닝 (한빛 미디어) 준비사항  파이썬, 주피터 노트북, 아나콘다 패키지 관리자가 설치된 PC 필요

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03-01-2024 ~ 12-31-2024

Course Introduction

강의시간 강의내용 실습여부 1 천연물 의약품 개발을 위한 예측기술/DB 및 모델링 접근법 소개 -     천연물 개요 및 의약품 개발사례 -     천연물 의약품 개발 연구에 활용 가능한 예측기술 -     천연물 기반 데이터베이스 -     예측모델 개발을 위한 모델링 접근법   2 천연물 데이터 수집 - 천연물 DB 데이터 수집 -     PubChem DB를 활용한 분자구조 데이터 수집 -     PubChem DB를 활용한 Bioassay 데이터 수집 O 3 예측모델 개발을 위한 구조기반 분자표현자 계산 -     분자표현자 기법 소개 -     RDKit을 활용한 분자표현자 계산 -     Mordred를 활용한 분자표현자 계산 -     PaDELPy를 활용한 분자표현자 계산 -     NC-MFP를 활용한 분자표현자 계산 O 4 예측모델 개발을 위한 데이터 전처리 -     데이터 정규화 및 표준화 -     데이터 불균형 문제를 위한 데이터 샘플링 -     데이터 전처리 및 샘플링 기법 구현 O 5 딥러닝 기반 예측모델 개발 및 활용 -     딥러닝 알고리즘 소개 -     DNN 알고리즘 구현 -     DNN 기반 정량/정성 예측모델 개발 및 성능평가 -     DNN 예측모델 활용 O

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